Agifes se estructura de la siguiente manera:
- Asamblea
- Junta Directiva
- Gerente
Áreas
- Recursos Humanos y Relaciones Laborales
- Subvenciones, Facturación y Administración
- Contabilidad económico-financiera
- Dirección de Programas y Mejora Continua
- Recepción
- Compras y mantenimiento
- Sensibilización y Comunicación
- Socios
Programas
- Acogida y orientación
- Formación externa
- Apoyo a personas con enfermedad mental
- Pisos
- Atención psicológica
- Familias
- Ocio y Tiempo Libre
- Voluntariado
- Atención a domicilio
- Trabajo social
- Centros de rehabilitación psicosocial
